कई आरोपों में अभियुक्त जाकिर नाइक भारत वापस नहीं आ रहा है। आपको बता दें कि मलेशिया के प्रधानमंत्री महातिर मोहम्मद ने कहा है, की वह जाकिर नाइक को प्रत्यर्पित नहीं करेंगे, जब तक वह मलेशिया में कोई गलत काम नहीं करता है। आपको बताते चलें कि जाकिर नाइक को मलेशिया का नागरिकता प्राप्त है और मलेशिया के प्रधानमंत्री ने साफ तौर पर कह दिया है कि जब तक जाकिर नायक मलेशिया में कोई समस्या खड़ा नहीं करता है, तब तक उसे भारत नहीं भेजा जाएगा। आपको बता दें की खबर आ रही थी की जाकिर नाइक को मलेशिया से भारत लाया जा सकता है, लेकिन यह खबर गलत निकली। जाकिर नायक ने भी यह साफ तौर पर कह दिया है कि वह भारत नहीं आ रहा है। जाकिर नाइक ने कहा है मेरा भारत आने का कोई प्लान नहीं है, जब तक निष्पक्ष सुनवाई नहीं होगी तब तक मैं भारत नही आउँगा। इसके अलावा नाईक ने कहा कि जब मुझे लगेगा कि भारत में निष्पक्ष सरकार है तब मैं वापस भारत आउँगा।
डॉक्टर नाईक के खिलाफ गैरकानूनी गतिविधियां रोकथाम अधिनियम (UAPA) और भारतीय दंड विधान की धारा 20 (b), 153 (a), 295 (a), 298 and 505 (2) के तहत आरोप तय किए गए थे. बांग्लादेश में आतंकी हमले को अंजाम देने वाले आतंकियों ने जब जाकिर से प्रभावित होने की बात कबूली, तो वो 1 जुलाई, 2016 को भारत से भाग गया। इसके बाद नवंबर, 2016 में जाकिर के खिलाफ केस दर्ज किया गया और दिसंबर, 2016 में जाकिर के एनजीओ को केंद्रीय गृह मंत्रालय ने बैन कर दिया था।